ecco.. basta utilizzare % .. modulo!

Codice PHP:
$acapo 0;
while (
$results mysql_fetch_array($result))
{
$title=$results['title'];
$url=$results['url'];
$description=$results['description'];
include(
"$url");

if( (
$acapo%3) == 
{
  echo 
'
'
;
}

$acapo++;

}