Per Skype non so aiutarti...
Per l'altro file, prova a eliminarlo dalla modalità provvisoria (al riavvio premi ripetutamente f8), altrimenti postami il percorso completo del file che ti do le istruzioni per eliminarlo (click destro sul file-->proprietà copia\incolla il percorso).
Il reporto di Hijack sembra pulito..direi che una volta cancellato quel file abbiamo finito. Per skype ti consiglio di aprire un topic in windows e software, spiegando il problema e mettendo un link a riferimento di questa discussione.

edit: mi raccomando, installa al più presto un antivirus o nel caso l'hai disattivato riattivalo..