Dovresti anzitutto provare a mettere un DOCTYPE corretto (non quella cosa che hai messo nella pagina).
Per far funzionare anche IE come gli altri (quasi), ti consiglio XHTML 1.0 Strict (senza prologo XML).

Vedi ad esempio questo manuale: DOCTYPE

Poi potresti avere ancora differenze, che puoi "curare" con i "commenti condizionali" (un riferimento tra i "link utili", altri mediante ricerca nel forum o in rete)