Quello non e` il file HTML, ma il programma PHP che lo genera, comunque e` proprio quello che devi modificare.
Al posto del DOCTYPE che nel tuo caso e` XHTML 1.0 Transitional (inizia con <! e finisce con >), devi scrivere la stringa corrispondente a XHTML 1.0 Strict, esattamente come proposta dal sito sopra segnalato.