Prova cosi:
codice:
<script type="text/javascript">
function checkIt()
{
   if(window.location.href.indexOf("pate_del_url_fissa.xxxx")!=-1)
   {
       window.open("applicazione");
   } else {
       alert("errore");
   }
}
</script>

<input type="button" value="Apri Applicazione" onclick="checkIt();" />