Il metodo ToString dell'oggetto Version prevede un output standard nella forma:
major.minor.build.revision
Per cambiare tale output puoi servirti delle proprietà dell'oggetto System.Version e fare una cosa del genere:
codice:
Me.LabelVersion.Text = String.Format("Versione {0}.{1}", My.Application.Info.Version.Major.ToString, My.Application.Info.Version.Minor.ToString)