codice:
function pulisciMotivazione(idRiga) {
	var checkbox = document.getElementById('propostaAnnoCorrente'+idRiga);
	if (confirm("Attenzione!!!\nL'eventuale modifica della proposta per l'anno corrente, cancellerà la motivazione già presente.\nVuoi proseguire?")) {
		document.getElementById('motivazione'+idRiga).value = "";
	} else {
		checkbox.checked=!checkbox.checked;		 
	}				
}
L'ho ottimizzata ancora aggiungendo il suggerimento di br1, cmq continuo a non capire dove sia il problema a me pare funzioni correttamente...