in teoria dovrebbe caricare anche gli script associati alla pagina, facendo questa prova a me funziona:

pippo.html

codice:
<html>
<head>
<script type="text/javascript" language="javascript" src="/script.js"></script>
</head>
ciao
<html>
script.js

codice:
function ciao(){
alert("ciao");
}
pluto.html

codice:
<html>
<head>
<script type="text/javascript" language="javascript" src="/jquery-1.4.3.min.js"></script>
</head>
<div id="divDaRiempire"></div>
<script>
$('#divDaRiempire').load('pippo.html',function(){
ciao();
});
</script>
</html>
Inoltre se usi firebug, vedi che jquery effettua n get per ogni js incluso nella pagina che stai importando... forse il tuo problema non è il mancato caricamento dei js, ma l'uso dei metodi o variabili dei js esterni quando jquery non ha ancora finito di caricarli completamente.