non farlo con .load, presuppone che la risposta sostituisca il contenuto dell' elemento
al contrario, tu vuoi settarne il value
codice:
$.ajax({
  url:'select.php?rif_fatt='+$('#rif').val(),
  success: function(data) {
    $('#tot').val(data);
  },
  error: function(){alert('sorry, something went wrong...')}
});