in breve:no

mysqladministrator ha "il suo" formato, non è che siano "tutti uguali".
tra l'altro codifica in utf8 praticamente sempre
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se vuoi andare sul sicuro "pulisci" a mano (o con un programma-script) il dump ed importalo direttamente da mysql.

normalmente bastano 5 minuti
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se invece vuoi... prova direttamente a fare il
mysql -uroot -ppassword nome_db <nome_dump.sql

se non c'è troppa "roba strana" dovresti riuscirci