probabilmente sono io che non riesco a spiegarmi bene, ma piu che metterti la documentazione ufficiale non so che fare, fatti delle prove metti degli alert nel codice cosi vedi la differenza.

codice:
<div id="nuovoid">ciao</div>  
<div id="nuovoid2"><div id="divcontenuto">ciao</div></div>  
<script>
alert($("#nuovoid").html());
alert($("#nuovoid2").html());
alert($("#nuovoid"));
//ecc...
</script>