Ni...
Può avere senso un unico file se si riesce a parametrizzare correttamente lo script, altrimenti si può fare qualcosa del tipo (poc)
codice:
codice vario
....
if (condizione1) {
include(file_con_script_per_condizione1.php)
} elseif (condizione2) {
include(file_con_script_per_condizione2.php)
} elseif ...

}

altro codice
...
in modo che se hai un problema con una sezione, agisci direttamente sul file relativo senza rischiare di far "casino" con tutto il resto che invece funziona