il link postato da zedr per me e' raggiungibile e il PDF delle linee guida lo puoi trovare qui
http://www.innovazionepa.gov.it/medi...iti_web_pa.pdf

Purtroppo (anzi per fortuna) io ho solo a che fare con Drupal (quindi non posso fare paragoni con Joomla) , ma in base al tema che vuoi applicare, dovresti controllare se il codice generato e' accessibile secondo le linee guide del decreto Stanca (ti consiglio di dare un occhio al tema ZEN)

Non basta inserire un riferimento alla legge per rendere un sito accessibile (se non ho capito male la tua domanda ...) , ma pur essendo a conoscenza degli standard e delle guideline per l'accessiblita' del w3c , sono curioso di sapere quali sono i requisiti "minimi" per un sito .gov.it