Scusa ho scritto velocemente, provo a spiegarmi meglio:

l esecuzione del comando

codice:
create database <nomeDB>
nel workbench crea un file nella directory /var/lib/mysql.

Questo valore di path corrisponde al valore di default della variabile datadir nel file my.cnf.
Tuttavia questo valore è stato da me modificato, pertanto mi aspetterei che il file in questione venisse creato nella cartella identificata dal path da me posto nella variabile datadir. Questo non avviene.

Grazie ancora
Ciao