Due strade.
QUESTA
...linka la /var/lib/mysql al percorso che hai settato nel my.cnf, ovvero:
Elimina il Db di prova che hai creato.
Assicurati che dentro /var/lib/mysql non ci sia nulla.
SE c'è qualcosa
codice:
sudo service mysql stop
sudo ls -l /var/lib/mysql
e postaci il risultato.
Se invece non c'è nulla
codice:
sudo ln -s /var/lib/mysql /path/percorso/settato/in/my/cnf
sudo service mysql start
Così, anche se il wb salva in /var/lib/mysql, fisicamente sta salvando nel percorso che hai messo nel my.cnf
OPPURE QUESTA
cerchi il file di configurazione del wb e modifichi la rispettiva riga che indica dove salvare i db