No.

Codice PHP:
$MySql "SELECT flag FROM utenti WHERE user = '$user'"
$Result mysql_query($MySql);

// letto il valore lo passo a una variabile che uso per il seguente if...
 
$team $Result
Esegui la query ma non estrai i risultati, ti manca come minimo una chiamata a mysql_fetch_array() o mysql_fetch_object() o simili.

Codice PHP:
$MySql "SELECT flag FROM utenti WHERE user = '$user'"
$Result mysql_query($MySql);

$row mysql_fetch_array($Result);

// letto il valore lo passo a una variabile che uso per il seguente if...
 
$team $row['flag'];