Hai assolutamente ragione Vincent.Zeno, il problema pare non avesse niente a che fare con gli include e deve essere stato un conflitto fra js.

HO SCOPERTO, del tutto casualmente, che se elimino nel file menu incluso le righe 51 - 52
codice:
<script src="http://www.google.com/jsapi"></script>
<script>google.load("mootools", "1.2.1");</script>
poi funzionano tutti e due gli script!!!!

Capisco quasi niente di js, evidentemente spostando gli script dentro e fuori gli include devo aver fatto qualche pasticcio...

Grazieeee!
Elimina pure tutti i link, se puoi. Ciaoooo!