Per chi è alle prime armi in effetti Magento può risultare un po' ostico, ma se non molli e superi gli scogli iniziali ti darà non poche soddisfazioni.
Per il discorso delle categorie guarda un po' se questo può esserti d'aiuto:
http://blog.danielegagliardi.it/prod...ie-di-magento/
Ricorda anche che le tue categorie, per essere visibili, devono essere sotto la "Default category" o la categoria che hai definito di base per la store view che stai utilizzando.