ciao,
i link che ti ho inviato sono link a moduli CPAN,
cioe' librerie scritte in Perl che consentono di aggiungere funzionalità di vario tipo al tuo codice (nel tuo caso la connessione FTP).

Nel link trovi la documentazione su come utilizzare i moduli (ad esempio è supportato certamente anche il login non-anonimo), basta che leggi come fare.

Siccome si tratta di moduli aggiuntivi del Perl, con tutta probabilità su Ubuntu dovrai installarli.

puoi farlo con:

gestore pacchetti

e poi cerchi

libnet-perl o qualcosa del genere.

Oppure da terminale:
cpan

e poi:

install Net::FTP

Queste sono le istruzioni per installare il modulo che ti occorre.

Poi, per fare girare il tuo programma in Perl ogni x minuti, puoi utilizzare crontab :
vedi ad esempio:
http://kevin.vanzonneveld.net/techbl...using_crontab/