I server di altervista hanno la safemode attiva quindi non puoi neanche pensare di usare comandi shell.
Però puoi settare i cronjob direttamente da altervista. Il costo è di 1 altercent a cronjob.
Io comunque ti consiglio un hosting su 000webhost
A differenza di altervista non hai limiti su php e mysql e puoi eseguire tutti i cronjob che vuoi.