è giusto come hai fatto tu, se non ti funziona il problema sta da un altra parte, non nel modo di richiamare la funzione che è corretto.

Prova e verificare che $uno valga effettivamente 1 prima di passarla alla funzione:
Codice PHP:
echo "il valore di uno è: ".$uno;
$maggiore il_maggiore ($uno,2,3);
echo 
"il maggiore dei tre numeri è: ".$maggiore