continuo a non capire, sei troppo vago nelle tue spiegazioni... la chiamata ajax con questo centra qualcosa? cmq per nascondere il tr ti basta modificare lo stile da script, se devi farlo dopo la chiamata ajax basta che ci aggiungi questa riga: mioOggettoTr.style.display = 'none';

codice:
var isConfirm = confirm("ATTENZIONE!!! \n\n La categoria selezionata verra eliminata. Procedere?");
if(isConfirm){ 
//chiamata ajax
mioOggettoTr.style.display = 'none';
}