l'idea dello script non è male, ti basta vedere se sei su win o linux e avviare un .bat o .sh a seconda di dove ti trovi. in quel caso aggiorni il classpath (ti consiglio di aggiungere a quello esistente il tuo jar) e avvii come sai fare.
Inoltre puoi scompattare il jar (che è niente di più che un archivio) e vedere nel manifest la main class