Codice PHP:
$path = "qui il percorso anno/mese/ in cui controllare";
$glob_latestlog   = array();
$glob_filescan    = array();
if ($handle = opendir($path)){
    while (false !== ($directory = readdir($handle))) {
        if( $directory != "." && $directory != ".." ) {
            if(is_dir($directory)) {
                $nameandtime['filename'] = $directory;
                $nameandtime['filetime'] = filemtime( $path.$directory );
                array_push( $glob_filescan, $nameandtime );
            }
        }
    }
    closedir($handle);

    if ( sizeof( $glob_filescan ) > 0 ){  
        /****** ordina per data ******/
        foreach ($glob_filescan as $key => $row){
            $fileage[$key]  = $row['filetime'];
        }
        array_multisort($fileage, SORT_DESC, $glob_filescan);
        $glob_latestlog = array_shift($glob_filescan);
    }
}
//$glob_latestlog contiene ora la directory creata più di recente

//leggi il nome della directory e ricavi il numero
//supponiamo che la directory si chiami "directory4"

$numero = str_replace("directory","",$glob_latestlog['filename']); //contiene 4

$numero++; //contiene 5

$nuova_directory = "directory".$numero;
//adesso crei la nuova directory e questa avrà il numero seguente all'ultimo già esistente 
Non ho provato questo codice, potrebbe esserci qualche modifica da fare, ma in linea di massima dovrebbe andare bene.