Una query è un'interrogazione del database.
per esempio:
codice:
query("SELECT id_utente FROM tabellautenti WHERE username = '$username' AND password = '$password'");
questa è la query per il login.
se cerchi guida php mysql su google trovi un ottima guida di html.it tra i primi risultati. io sto imparando così.

non posso essere più preciso, tutto dipende da cosa devi fare.