Sei sicuro che la funzione converti_accenti() funziona correttamente no?
Se si, vedi di fare delle prove diverse, cioè controlla se la funzione rename effettivamente rinomina il file.
Mi spiego meglio, invece di rinominare con il vero nome che ti serve prova con un semplice "pippo.estensione"...

Codice PHP:
$PDF rename($_FILES['txtPdf']['tmp_name'],"pippo.estensione");