...anche perchè nel caso si tratti di script php che "outputtano" grafica, sarebbe meglio usare le super globali...

codice:
<?php
$css_path = "{$_SERVER['DOCUMENT_ROOT']}/css/";
$output = <<<EOF

<link rel="stylesheet" href="{$css_path}/style.css" type="text/css" />
....

EOF

;
Altrimenti meglio usare il percorso assoluto...senza host
codice:
<link rel="stylesheet" href="/css/style.css" type="text/css" />