Una volta fatto il riferimento a Microsoft Script Control, basta fare:

codice:
  Sub Button1_Click(sender As Object, e As EventArgs) Handles Button1.Click
    Dim ScrCtr As New MSScriptControl.ScriptControl
    ScrCtr.Language = "VBScript"
    ScrCtr.AddCode(IO.File.ReadAllText("C:\ScriptFile.vbs"))
    MsgBox(ScrCtr.Run("Prova", 10))
  End Sub
Al posto di VBScript è possibile scrivere anche JavaScript