Semplicemente dovrai richiamare la funzione che controlla se ci sono nuovi messaggi ogni tot di tempo, ma mi sa che questa discussione è più js che php...

Per esempio in passato, usando prototype, avevo scritto qualcosa del genere:

codice:
/**
 * riceve i messaggi della chat via AJAX
 * richiama ricorsivamente la stessa funzione
 * ogni secondo per aggiornare i messaggi
 */
function getMessages()
{
	new Ajax.Request('tuo-script.php',
			  {
			    requestHeaders: {Accept: 'application/json'},
                            parameters: {id_last_message : $('message_id_last_message').value,
                                         id_chatroom : $('message_id_chatroom').value
                                        },
                            onSuccess: function(transport){                                
                                var json = transport.responseText.evalJSON(true);

                                //aggiorno la lista con i messaggi
                                json.messages.each(function (n)
                                {
                                    spanElement = new Element('span');
                                    spanElement.update(n.username+': ');

                                    liElement = new Element('li');
                                    liElement.update(spanElement).insert(n.data.sub(':)', ' [img]/images/smiley_30x30.png[/img]'));

                                    $('messages').insert( { bottom: liElement } );

                                    //scrolla in basso il div
                                    $('chat').scrollTop = $('chat').scrollHeight;

                                });

                                //aggiorno la chat ogni secondo
                                window.setTimeout( getMessages, 1000 );

                                //aggiorno il campo hidden con l'ultimo id
                                //se json non è vuoto
                                if(json.messages.lenght!=0)
                                {
                                  $('message_id_last_message').value = json.messages[0].id
                                }
			    },
			    onFailure: function(){ alert('Si è verificato un errore...'); }
			  });
                          
}
quindi tuo-script.php farà una query al db per vedere se ci sono messaggi più recenti dell'id dell'ultimo messaggio e restituirà i risultati in JSON. Infine prototype aggiornerà la pagina con gli ultimi messaggi...


Vedi se può esserti utile...