Ma non sarà un limite di PHP ??
i 2mb prestabiliti dalla configutazioni di php
ti sei risposto da solo

se sul tuo server, nelle direttive tipo upload_max_filesize, post_max_size,memory_limit hai dei limiti a 2M, non potrai caricare file piu' grandi di 2M.

Per intenderci:
il primo passo e' l'upload del file dal browser dell'utente sul server A.
Il secondo e' il ftp_put del file dal server A al server B.

Se il file non arriva sul server A, durante il primo passo, a causa dei limiti imposti nella configurazione, non riuscirai mai ad arrivare al passo 2.