Trovato

codice:
@echo off
set cartella="E:\test"
del /S /Q "%cartella%"
for /D %%d in ("%cartella%\*") do (
  for /D %%f in ("%%d\*") do rmdir /S /Q "%%f"
)
In pratica prima elimino dalla cartella richiesta tutti i files in maniera ricorsiva, poi scorro le subdirectory eliminandole, compreso il contenuto.
La struttura di primo livello rimane così intatta.

ciao