Grazie dei consigli!
Comunque sto studiando la classe direttamente dal sito di FPDF,l'errore che mi dava l'ho risolto scrivendo "ob_end_clean();" all'inizio dello script,prima di "require('fpdf.php');" per intenderci.Ed adesso sto sviluppando dei pdf-tipo partendo dai tutorial (sempre dal sito di FPDF che è fatto molto bene),ed aggiungendo grafica e dettagli.
Adesso devo solo integrare MySql e riuscirò a fare tutto con questa classe