Grazie! Sono riuscito a fare anche questo che funziona, ve lo posto se può essere d'aiuto a qualcuno:

codice:
    
    $(document).ready(function() {
	  $('.orari').each(function(){ // i <tr> di destinazione
	    var id=$(this).attr("id"); //carico l'attributo id di ogni <tr>
	    $('.andata').each(function(){ // per ogni riga da spostare nei <tr> precedenti...
	      if($(this).hasClass("."+id) && (!$(this).hasClass(".del"))) // ..controllo che la sua classe sia uguale all'id del <tr> contenitore
              {
		$(this).remove(); // in caso positivo lo rimuovo dal calderone generale
		$("#"+id).after(this); // e lo posizione sotto il <tr> che lo deve contenere
              }
	    });
	  });
    });
Grazie ancora, alla prossima!