Ferma tutto! Ho capito...

Il problema era che su quel dominio era attivo il safe_mode che come si vede da qui

http://php.html.it/articoli/leggi/85...ioni-sicure/2/

'Qualsiasi chiamata di sistema (vedi exec(), system(), passtru()) può riguardare esclusivamente gli eseguibili inseriti nella "safe_mode_exec_dir" indicata.'

Al momento non ho guardato come si configura la 'safe_mode_exec_dir' che potrebbe essere interessante (anzi se qualcuno vuole dare una dritta ben venga...), ma ho semplicemente disabilitato il safe_mode e tutto funziona correttamente.

Grazie
ciao