Così dovrebbe andare:

codice:
<SCRIPT type="text/javascript">
	var settimmer = 0;
	var arrPages = new Array("PRIMAPAGINA","PAGINA1","PAGINA2","PAGINA3", "ETC ETC");
	var i=1;
	function ChangePage(s){
		$('#main')[0].src = arrPages[s];									
	}
			$(function(){
                window.setInterval(function() {
                    var timeCounter = $("b[id=show-time]").html();
                    var updateTime = eval(timeCounter)- eval(1);
                    $("b[id=show-time]").html(updateTime);
                    if(updateTime == -1){
			if(!arrPages[i]){ i = 0;}
			ChangePage(i);
			i++;
			$("#my-timer").load(location.href+" #my-timer>*","");													
			}
                }, 1000);

        });

</SCRIPT>
La pagina cambierà tra <span id="my-timer"><b id="show-time">3[/b]</span> secondi
<iframe src="PRIMAPAGINA" id="main" width="1352" height="590"></iframe>
<div style='display:none;'>%%MENU%%</div>
<div style='display:none;'>%%CONTENT%%</div>
<div style='padding: 20px; width:100%; text-align:fixed center;'></div>
Ti ricordo di includere la libreria JQuery...se vuoi c'è quella messa a disposizione da Google:
codice:
<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.4.2/jquery.min.js"></script>
Ma puoi anche importarla sul tuo sito scaricandola da internet! :P