Il problema non è explorer ma il tuo codice, anche con Firefox non si ha una visualizzazione corretta. Se vuoi che le tabelle siano rese perfettamente devi impostare precisamente le dimensioni di ciascuna cella e specificarne anche l'altezza, nella pagina che hai lincato hai un'intestazione, tre colonne centrali e un footer, nello schema che ti ho indicato hai la struttura primaria, cella unica in alto e in basso e tre colonne centrali, poi puoi inserire altro all'interno. Quello che non va è che non conviene impostare le altezze in percentuale perché l'intestazione deve avere dimensioni fisse, il footer pure e il corpo centrale comunque dovrà adattarsi al testo quindi faclmente sforerà il 100%.
Poi, non essendo quel layout particolarmente complicato, invece di scervellarsi con le tabelle, sarà più semplice usare direttamente box e css. Trovi già pronti in rete layout di quel tipo e comunque sarà sufficiente un div che contenga tutto, un div per l'intestazione, uno per il menu e poi uno per il contenuto centrale e uno per il footer. Nel div centrale costruirai le tre colonne usando il float, qui il primo tutorial che mi è capitato cercando in rete sul float http://css.maxdesign.com.au/floatuto...torial0916.htm , puoi sostituire alle larghezze percentuali una larghezza fissa.
E' il sistema più rapido, accessibile, snello e corretto nel codice
(cerca anche layout fissi a tre colonne)