codice:
             cin >> numero[1];
hai scritto 1 invece di i, per cui tutti i dati inseriti vengono salvati nel secondo elemento, e gli altri restano al valore a cui già sono (potrebbe essere qualunque cosa, per caso nel tuo caso è 0).
Per evitare questi sbagli in futuro ti consiglio di usare nel tuo editor un font appositamente pensato per la programmazione (ad esempio Consolas su Windows, o Inconsolata su Linux), che evidenziano bene le differenze tra caratteri "critici" (1, i, I, l, ...).