@scinti Io ho cancellato tutto dall' hd esterno e cisono queste cartelle residue, non credo che sia dovuto al fatto di un errore di smontaggio / montaggio...
Quanto al filesystem, è sì, NTFS.
Tuttavia l'hd esterno è partizionato e sono tutte NTFS.
Ad ogni modo, io adesso ho liberato 20 GB dal mio nuovo hd con GParted (e accidenti, non parte più il GRUB!!!!) e ci ho messo Windows 7 (anche perché non è che Wine sia universale).
E se provassi da quì a rimuovere i files?

Scusate se forse sto andando fuori sezione dato che adesso il problema diventa "windows" e software... ma è solo un pensiero; se ne avrò bisogno, aprirò una nuova discussione...