ok forse ho risolto
nella pagina che deve essere caricata in ajax ho scritto il seguente codice
Codice PHP:
    <script type="text/javascript" src="http://maps.google.com/maps/api/js?sensor=false&callback=handleApiReady"></script>
    <script type="text/javascript">

      function handleApiReady() {
        var mapDiv = document.getElementById('map-canvas');
        var map = new google.maps.Map(mapDiv, {
          center: new google.maps.LatLng(37.4419, -122.1419),
          zoom: 13,
          mapTypeId: google.maps.MapTypeId.ROADMAP
        });
      }
      

      
    </script>

    <div id="map-canvas" style="width: 500px; height: 400px"></div> 
Non mi resta che provare a far funzionare i controlli che avevo sull'altra mappa