Ti confesso che...io faccio prima tutto il lavoro e poi eventualmente mi occupo delle correzioni. Guarda finora le correzioni maggiori che ho dovuto fare riguardavano la grafica. Per ciò che riguarda gli script solo una volta ho dovuto informarmi ed apportare una modifica (secondo la fonte trovata).

Da lì in poi, non ho ancora trovato intoppi con jQuery (e la versione che sto usando). E ti dirò: faccio uso di modali, modali dentro modali, modali mouseover/mouseout, animazioni->fadeIn/fadeOut..

..per ora nessun problema.

Ma dato che la sola parola mi fa scattare il puntino in testa, ora provo sugli altri browser (finora non l'ho fatto ) e magari ti dico alla prossima risposta.