Per ora sì, ma poi devo poter fare altro.
Per ora con exec($command, $output) sono riuscito a fargli fare la prima parte del lavoro. Poi con la funzione explode ho tagliato la stringa in modo da avere i dati presi dal CSV ben conservati nelle variabili PHP.
Possiamo dire che per ora ho risolto il mio primo problema. Tante grazie! : )