In B.php metti uno di questi:

require __DIR__ . '/../C/C.php';
require realpath(__DIR__ . '/../C/C.php');
require realpath(dirname(__FILE__) . '/../C/C.php');

... come vedi hai ampia scelta! Quando tu ricavi il path assoluto di B in B.php, basta che da questo ti sposti uno dietro (quindi stai in A) e poi vai avanti (quindi vai a prendere C.php in C).