Un'altra cosa che dovresti configurare è l'impostazione colore di illustrator (o di tutta la suite tramite bridge).

Di solito si usa la Prestampa Europa per i lavori off-set.

Uno dei grandi vantaggi nel passare da Inkscape (e non solo) a Illustrator è proprio la gestione del colore.
Con tutti i limiti del caso è il programma (o programmi se consideri tutta la suite adobe) che garantisci una coesione tra tutti i passaggi necessari nella filiera di stampa.