L'unica cosa che ti consiglio di fare cmq è di separare logica da markup (html).

ti faccio un esempio terra terra.
head.php
Codice PHP:
<html>
<head>
    <title><?php echo $title; ?></title>
</head>
<body>
content.php
Codice PHP:
<h1><?php <?php echo $title; ?></h1>


<?php echo $content; ?></p>
footer.php
Codice PHP:
</body>
</html> 
tua_pagina.php
Codice PHP:
<?php
/* 
qui posizioni la logica della tua pagina
ad esempio:
    - inclusioni di classi che potrebbero servirti
    - estrazione dei dati dal db
*/
$title = 'la mia pagina'; 
$content = 'contenuto pagina';

include('head.php');
include('content.php');
include('footer.php');
?>
Questo modo di organizzare il codice ti aiuterà a comprendere meglio come operare quando passserai a cose più complesse (MVC).