Non è facile rispondere, bisognerebbe andare per indizi... per esempio:

Io ho la versione a 64 bit e spesso incontro problemi ad installare vecchi software, tu ne hai mai installati/incontrati?

Avevi un solo IE o due? Il mio PC ne ha uno "normale" e uno a 64bit ma onestamente non so che differenze ci siano.

La tua azienda ha distribuito altri portatili? Potresti vedere in che situazione sono quelli.

Chi ha assemblato il pc è una persona seria, organizzata, precisa che difficilmente può aver scanbiato i dvd oppure è un pasticcione?

L'architettura del peocessore e della scheda madre è a 32 o a 64 bit?

Può darsi che Microsoft abbia product key diversi (strutturalmente diversi intendo) per le due versioni, potresti provare a informarti su come è fatto un codice per 64 bit e confrontarlo col tuo.

Non mi viene in mente altro per ora.
Ciao