Credo siano un po cambiate le cose, ti posto questo link se non lo conosci già:

link

Comunque per esperienza acquisita e non certo perché sia un conoscitore di hosting, alcuni di questi evitano di utilizzare joomla su windows per "ragioni di sicurezza" dicono loro.

Gestivo un sito fatto con joomla su piattaforma windows e funzionava benissimo, moduli compresi.