Io non l'ho provato ma generalmente funzionano tutti allo stesso modo, salvano la parte selezionata.

Dopo aver fatto i tagli che vuoi seleziona la parte che vuoi tenere e fai salva, controlla che a volte c'è la voce salva selezione o simile.

Oppure dopo aver fatto i tagli seleziona le parti che non vuoi ed eliminale con il tasto canc opure dal menu modifica(edit)>elimina(delete) e salva il file normalmente