Prova ad eseguire uno scandisck dell'hd esterno. Clicchi con tasto destro sull'icona dell'hd selezioni proprietà ti dovrebbe dare l'opzione scandisck.

Se con windows non viene rilevato, prova a collegarlo ad un pc con linux, oppure scaricati una distro live di linux e guarda se con quella riesci a risolvere.