Prendere una decisione simile è più complesso di quanto possa sembrare, ci sono una serie di fattori che concorrono a creare problemi di visualizzazione e che andrebbero risolti volta per volta.
Le vie più semplici sarebbero se:
- il sito che stai realizzando fosse in swf full-browser allora dovresti necessariamente realizzare la cosa solo in flash.
- il tuo sito fosse in html sarebbe meglio invece che seguissi la strada del lightbox (o meglio del thickbox che è più indicato nel tuo caso).
Mi fermo qui perché non ho altre informazioni su cui basarmi.