da root in home?
root ha già da se i privilegi assoluti sull' intero SO , inclusi tutti gli utenti dei quale root può deciidere di vita e di morte.

non c'è alcun bisogno di scomodare nautilus , ti installi il filemanager per la console : mc (midnight commander)
apt-get install mc
lo lanci e da mc con privilegi root acquisiti , esegui tutte le operazioni che vuoi sull' intero SO direttamente dalla console con mc .